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 ヴェトナム・カッティエン国立公園で捕獲されたネズミ科のDNAバーコーディング法を用いた種同定及び餌資源予備調査
  石澤, 祐介; 白子, 智康; 味岡, ゆい; 上野, 薫; Do Tan Hoa; Tran Van Thanh; 山田, 祐彰; 南, 基泰, 2012.03. -- (生物機能開発研究所紀要 ; No. 12 (2012.3)). w.  <XC12000272>
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書誌
タイトル
ヴェトナム・カッティエン国立公園で捕獲されたネズミ科のDNAバーコーディング法を用いた種同定及び餌資源予備調査
タイトル(その他)
ヴェトナム カッティエン コクリツ コウエン デ ホカク サレタ ネズミカ ノ DNA バーコーディングホウ オ モチイタ シュドウテイ オヨビ エサ シゲン ヨビ チョウサ
タイトル(その他)
Preliminary notes on identification of Muridae and their food resources using DNA barcoding in Cat Tien National Park, Vietnam
作成者
石澤, 祐介||イシザワ, ユウスケ||Ishizawa, Yusuke
作成者
白子, 智康||シラコ, トモヤス||Shirako, Tomoyasu
作成者
味岡, ゆい||アジオカ, ユイ||Ajioka, Yui
作成者
上野, 薫||ウエノ, カオル||Ueno, Kaoru
作成者
Do Tan Hoa
作成者
Tran Van Thanh
作成者
山田, 祐彰||ヤマダ, マサアキ||Yamada, Masaaki
作成者
南, 基泰||ミナミ, モトヤス||Minami, Motoyasu
公開者
中部大学生物機能開発研究所
書誌構造リンク
ISSN
13464205
雑誌名
生物機能開発研究所紀要
巻次等
12
開始終了ページ
33-54
発行日
2012.03
主題
Cat Tien National Park, Muridae, DNA barcoding
内容記述
ヴェトナム国内最大級の熱帯雨林を保有するカッティエン国立公園において,2011年3月8日から16日の間,国立公園内の17箇所でネズミ科の生息及び餌資源について予備調査を行った.ネズミ科2属3種(4個体)(シナシロハラネズミNiviventer confucianus,ヒマラヤクリゲネズミN.fulvescens,クマネズミ属Rattus sp.)を捕獲することができた.特に,種同定のためにミトコンドリアDNA のD-loop 及びCOI を利用したDNA バーコーディング法は,従来の外部形態及び頭骨形態による種同定に比べ,熟練した鑑定技術を必要としない技術であることが確認できた.このことから,種特異的な形態的特徴の判定が困難なネズミ科の種同定のためのツールとしてDNA バーコーディング法は有効であると考えられた.また,餌資源推定についても胃腸内容物より全DNA を抽出し,DNA バーコーディング法を用いて植物性(rbcL)及び動物性(COI)被食物共にBLSAT 検索を行い,植物由来被食物ではツルアカメガシワ(Mallotus repandus)(Euphorbiaceae トウダイグサ科),キデナンツス属一種(Chydenanthus excelsus)(Lecythidaceae サガリバナ科),ハマビワ属一種(Litsea timoriana)(Lauraceae クスノキ科),アメリカハマグルマ(Sphagneticola trilobata)(Compositae キク科)の4 種が,動物由来被食物としてシロアリ科 (Termitidae シロアリ科),ミドリゼミ属(Dundubia nagarasingna)(Cicadidae セミ科),ウデムシ目(Amblypygida)の3 種が推定され,今後餌資源推定のためには有益なツールであることが確認できた.また,罠捕獲地点の植生データと照合することによって,餌資源となる植物や動物性餌資源に寄与する植生などの推定が可能となるので,今後の哺乳類相保全のための熱帯林保全指針として活用できると期待された.
内容記述
A preliminary field survey of Muridae species and their food resources in Cat Tien National Park, Vietnam was conducted between March 8 and 16, 2011, during which three species of mice were collected and identified. Species were identified through both DNA barcoding using polymorphic DNA within the mitochondrial D-loop and COI sequences as well as examination of external morphological features such as body and skull shape. Three species of mice, Niviventer confucianus, N.fulvescens and Rattus sp., were identified using the methods outlined above. In order to estimate plant and animal food resources available to Muridae species within the study area, total DNA was extracted from the gastric contents of each mouse specimen collected. Chloroplastic rbcL and mitochondrial COI within extracted gastric contents were amplified by PCR and used to identify plant and animal food resources, respectively. Homology search using BLAST was also conducted in order to identify food resources within extracted gastric contents. Results indicated that genetic material from four plant species, Mallotus repandus (Euphorbiaceae), Chydenanthus excelsus (Lecythidaceae), Litsea timoriana (Lauraceae), and Sphagneticola trilobata (Compositae), as well as genetic material from three animal species, an unidentified species from the Termitidae family, Dundubia nagarasingna (Cicadidae), and Amblypygida sp., were present. DNA barcoding methods were able to provide valuable information that assisted in the identification of Muridae specimens as well as their food resources, both plant and animal. The methodology used in the present study could be applied to the management of sustainable use of mammalian food resources within tropical forest environments.
登録日
2013.03.28
資源タイプ
調査報告
資料種別(NIIタイプ)
Departmental Bulletin Paper
フォーマット
PDFファイル
著者版フラグ
publisher
機関名
中部大学
外部リンク
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